杨雯迪1, 马玉超1, 王金鹏1, 沈建国2, 任争光1, 杨海清3, 李为民1*.树生黄单胞菌李致病变种两种PCR检测方法的建立[J].植物保护,2024,50(5):224-229. |
树生黄单胞菌李致病变种两种PCR检测方法的建立 |
Two specific PCR assays for detection of Xanthomonas arboricola pv. pruni |
投稿时间:2023-11-15 修订日期:2023-12-31 |
DOI:10.16688/j.zwbh.2023589 |
中文关键词: 树生黄单胞菌李致病变种 常规PCR TaqMan探针法 特异性 灵敏度 |
英文关键词:Xanthomonas arboricola pv. pruni conventional PCR TaqMan real-time PCR specificity sensitivity |
基金项目:国家自然科学基金(32170190) |
作者 | 单位 | E-mail | 杨雯迪1, 马玉超1, 王金鹏1, 沈建国2, 任争光1, 杨海清3, 李为民1* | 1. 北京农学院植物保护系, 农业农村部华北都市农业重点实验室, 北京 102206 2. 福建省检验检疫技术研究重点实验室, 福州海关技术中心, 福州 350001 3. 平谷区果品产业服务中心, 北京 101200 | weimin.li@bua.edu.cn |
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中文摘要: |
树生黄单胞菌李致病变种Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap)是桃、李生产中最具毁灭性的病原细菌之一。为了快速准确地检测Xap, 本研究以其编码基因L1B16_06350的5′端序列(611 bp)为检测靶标, 开发了常规PCR和TaqMan实时PCR检测方法。这两种方法与树生黄单胞菌胡桃致病变种X.arboricola pv. juglandis等8个不同属的11种细菌均没有交叉反应, 其中常规PCR检测极限为10-2 ng, TaqMan探针法为10-3 ng, 表现高度的灵敏度和特异性。利用田间样品进行测试, 结果证实两种检测方法均可应用于Xap的常规检测。 |
英文摘要: |
Xanthomonas arboricola pv. pruni (Xap) is one of the most devastating bacterial pathogen to peach and plum. To rapidly and accurately detect Xap, we developed a conventional PCR and a TaqMan real-time PCR assay that targets the 5′end (611 bp) of L1B16_06350, a Xap encoding gene. Both methods had no cross-reaction with 11 tested bacterial species from eight different genera, including X. arboricola pv. juglandis etc., with a limit of detection of 10-2ng for the conventional PCR and 10-3 ng for the TaqMan method, respectively, showing high sensitivity and specificity. Field sample test proved the reliability of the two methods in routine diagnosis of Xap. |
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