| 周莹1, 尚巧霞2, 罗 晨1, 乔广行1, 刘梅1, 张玮1, 燕继晔1*.番茄黄化曲叶病毒的鉴定与群体进化分析[J].植物保护,2016,42(1):106-111. |
| 番茄黄化曲叶病毒的鉴定与群体进化分析 |
| Identification and evolutionary analysis of Tomato yellow leafcurl virus isolates in China |
| 投稿时间：2015-01-15 修订日期：2015-03-25 |
| DOI： |
| 中文关键词: 双生病毒鉴定 基因组变异 系统发育 |
| 英文关键词:identification of geminivirus genetic variation of genome phylogenetic analysis |
| 基金项目:公益性行业(农业)科研专项(201003065); 北京市农林科学院青年科研基金(QNJJ 201320) |
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| 中文摘要: |
| 番茄黄化曲叶病(tomato yellow leaf curl disease, TYLCD)是番茄上的重要病害, 可由多种双生病毒引起。为了明确北京地区番茄黄化曲叶病的病毒种类和病毒基因组变异情况, 本研究收集了51个采自北京不同区县的病毒疑似样品, 进行了双生病毒的检测及分离物的基因组分析。经双生病毒简并引物检测25个样品呈阳性; 扩增获得10个代表性分离物的全基因组, 大小均为2 781 bp, 共含有6个开放阅读框; 经比对, 10个分离物与Tomato yellow leaf curl virus-Israel (TYLCV-IL)同源率大于99%; 基于我国TYLCV分离物全基因组序列的变异分析表明, TYLCV在进化上比较保守, 整个基因组上的变异是不均匀的; 系统发育树显示我国TYLCV分离物在进化树上可分为3个组群, 分析了我国TYLCV群体进化情况。 |
| 英文摘要: |
| Tomato yellow leaf curl disease (TYLCD) is an important disease of tomato caused by many geminiviruses. A geminivirus was found in 25 of the 51 samples collected in Beijing, and complete genome sequences of 10 isolates were determined. All of the sequences contained 2 781 nucleotides encoding six proteins and shared more than 99% nucleotide identity with Tomato yellow leaf curl virus-Israel (TYLCV-IL). Genetic analysis based on the genome sequence of TYLCV isolates in China revealed that TYLCV had little genetic variability, and phylogenetic analyses showed that they clustered into three groups. |
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